在紧锣密鼓修横原堡的同时，欧阳轩还命黄大根将花果山堡垒化，作为水军的常驻营地。一方面水军发展自然离不开水，鸡冠山中自然是不适合，横原堡则要驻扎野战营，而水路发达的永渠乡并无紧固防御建筑，欧阳轩思来想去，还是决定将水军营地设于此。与横原堡纯军事用途不同，原为水匪老窝的花果山主要为民用，其易守难攻除了隐秘外更因为唯一的出入口狭窄，但只要进攻方不惧伤亡则仍能被攻破，一旦寨破则逃无可逃，这便是兵法上所说的“死地”。按照欧阳轩的要求，花果山营地须被建为军民两用且进可攻退可守。
从军事角度来看，花果山营地要达到长期坚守并不难，只需用少量石头水泥及钢铁加固寨墙和大门，再架上几门火炮，便可做到一夫当关万夫莫开，难的是在大量杀伤敌人后安然撤离。黄大根在营地内细看了几日，终于发现山沟尽头有处稍缓的山崖，这山崖高约百米，除却中段部分有块突出挡路的巨石外，其余地方借助绳索倒是可以攀爬上去。这挡路巨石不下数十万斤，是人力不可逾越的挑战，但对拥有火药的霹雳军这并不太难，经过几次爆破后便被顺利清理掉。借助这条隐秘而险峻通道，霹雳军可以在无法坚守的时候逃出营地，遁入无根山的密林之中，也可以战事吃紧的关键时刻，从敌人背后发动偷袭。
在霹雳军高层关于在平原的初期发展布局中，霹雳军总部将在横原堡完工后迁于此，随同驻扎在横原堡则有野战营及内卫营。作为主力的野战营驻扎于此，可使霹雳军进可攻退可守，只要横原堡不被攻破，山中则安全无虞；内卫营也驻所于此主要是为了侦察连和锄奸连外出执行任务。至于警卫连和反谍连也设在此，则是因为外来人员要进入山中必须经过此地，可以提前进行甄别。外来人员要进入山中需有担保人，沿途岗哨和巡逻士兵除查看来人的路条外，同时还要严格盘查和搜身，山外的奸细和探子要混入山中几无可能。余柱率领的守备营则驻守在万家堡，兵力除了常设单位教导连外，还有三个基干民兵连定期轮换驻扎。按照霹雳军全民皆兵、全员军训的要求，守备营已组建了三十个民兵连，这些连的普通民兵每月需要自带干粮训练三日，而这些民兵连的班、排长则组成了三个基干民兵连，实行半脱产管理。
按照霹雳军政会议的决定，黄大根率水军营三个连驻扎无根山，以花果山营地和永渠乡黄家荡为基地。黄大根利用初春枯水时节将黄家荡的进出水道拓宽了不少，以便将水军战船藏入其中，同时又构置了防御设施和物资储存点，做了长期持久战的准备。横原堡完工后，将与花果山营地、黄家荡互为支援。欧阳轩明白这样的布局只能让霹雳军在山下站稳脚跟，但如果要在平原地区发展，必须利用川西平原纵横交错的河道水网，建设一支强大的水军，才能与高机动性蒙古骑兵对抗，而当前霹雳军的水军还太弱小。水军属于技术军种，要扩建却不是容易之事。一方面相对步军，水军耗费资金和资源更多，就拿战船来说，除了需要大量工匠和木材外，其建造周期也长，如果要配备火炮则所需费用更是惊人。前期水军战船上使用的火炮是临时从野战营调来，在黄家荡剿灭水匪之战中，发现并不十分适合水战使用。欧阳轩已命人试制适合战船使用的火炮，但受制于火炮产能，要将目前的二十艘战船配备到位也尚需时日；另一方面培养精于水性和水战的军官和水手队伍也需要时日。现在黄大根已未雨绸缪，开始着手培养水军骨干，也选派了班排长进入教导连进修，但按照欧阳轩的设想，这种培养力度远远跟不上设想中水军的规模。
当然水军快速扩张的还一种办法便是接收官军水军士兵的归附。虽然官军整体上战力孱弱，但这是举国上下文适武嬉的风气造成的，各军中仍有不少忠勇热血男儿，经过淘汰拣选后便能快速成军。只是霹雳军名义上仍属官军，即便对潘罗欢这等“友军”，也是不敢明目张胆挖人的，就连余老挖、乐全安、廖泥鳅等人与原同僚的交往也停留在私人层面。这种交往起初只是情谊方面，多是霹雳军接济府城和甚至新津城留守水军的钱粮盐布，后来便扩展到了暗通有无的商贸生意往来，交往也由偷偷摸摸变为半公开化了。随着交往的加深了解，府城和新津城的官军士卒对霹雳军治理越发羡慕，对潘罗欢也就越发厌恶。“断人财路如杀人父母”这种经济上的联系潘罗欢根本就禁止不了，再加上他的亲信也得了好处，都睁一只眼闭一只眼，唯有他一个人被瞒在鼓里。对于霹雳军士兵与府城和新津城留守水军的私下联系，欧阳轩不仅清楚甚至这原本就是他的授意。
欧阳轩虽然拒绝了潘统制索要提供火炮、钱粮和修府城免费劳力的要求，但仍从抗蒙大业角度出发，以霹雳军名义送了一批农具和种子到崇庆府城，不想却被潘罗欢拒收了。这个纨绔子弟见送来的不是火炮、钱粮和可供驱使的民壮，放下狠话便怒气冲冲拂袖而去。他对劳心费神耕种的农事压根没有兴趣，与美女游龙戏凤的房事才是他感兴趣的。黄大根便让廖泥鳅和余老挖将这农具种子偷送给昔日同僚，这让水军汉子们十分欢喜。潘罗欢不屑要霹雳军的种子农具，但他手下的士卒却是想要。“民以食为天”，春不种则秋无粮，如果没有粮食，潘罗欢不一定挨饿，但手下的士兵肯定会挨饿。
崇庆府属于川西膏肥之地的核心区。府城周围的土地极其肥沃，光热条件也非常优越，可以秋播小麦春种水稻。霹雳军所开垦的土地多为旱地，只能种植小麦、高梁、大豆等旱作物。廖泥鳅和余老挖送给昔日同僚的种子却多是水稻种子。这水稻亩产要比旱作物产量高许多，但对灌溉条件的要求也高，正适合在水网发达的平原种植。只是府城周围文井江东岸的土地多在去年秋季种上了小麦等旱作物，只待夏收后便可移栽水稻秧苗，并没有太多的闲置地。
廖泥鳅和余老挖便建议昔日的同袍到文井江西岸开荒。西岸之所以荒地多，主要是隔河耕种并不方便，特别是雨季的洪水更使通行不便，这个困难对水军士卒显然不是问题。虽然西岸水利设施年久失修，但基础尚在，只需下番力气重新整治便可。此次霹雳军送来的铁制农具极为精良，甚至比潘罗欢许多手下的兵器质量还好上许多。有了称手的工具，加上此处泥土松软，用不了多少时日便能重建沟道和水渠系统。廖泥鳅和余老挖还按霹雳军屯田的经验，让府城士卒将西岸的屯田也都控制在离河一里距离内，又指导在屯田的外围和内部开挖纵横交错的的水渠和大量陷马坑，以防备和迟滞蒙古游骑的袭扰。